Il Parlamento europeo patisce un'originaria fragilità istituzionale, che è anche la causa della sua permeabilità a pressioni e a interessi estranei alla garanzia dei diritti dei cittadini europei. Sin dagli esordi del progetto per un'unità europea, la costante tensione tra modelli federalisti e soluzione funzionalista ha alimentato tale deficit congenito, nei termini della problematica riconduzione al Parlamento europeo delle categorie della rappresentanza e della responsabilità politica, nonché del parziale esercizio della funzione legislativa, quest'ultima connotata da prassi poco trasparenti, che contribuiscono ad accentuare il difetto di legittimazione democratica dell'intero sistema europeo.