Tutto sembra essere perfetto nel villaggio di Hinamizawa in cui Keiichi si è appena trasferito con la sua famiglia. Ma dietro l'apparenza, si cela qualcosa di macabro: Keiichi inizia a dubitare di tutto e di tutti quando viene a scoprire delle misteriose sparizioni che si ripetono ogni anno, taciute misteriosamente dai residenti del villaggio.