Hakkenden racconta una storia di rinascita, di orrori e di forti sentimenti. La vicenda inizia quando una terribile epidemia stermina quasi tutti gli abitanti del villaggio Ootsuka... L'unico sopravvissuto, testimone di tanta sofferenza, stringe un patto con un uomo misterioso, che gli propone di riportare alla vita le persone a lui care. Da questo momento inizia una fantastica, tragica avventura che coinvolge la chiesa dove il ragazzo risorto trova rifugio, i suoi due amici richiamati dalla morte, e la ricerca della spada demoniaca "Murasame", che si dice contenga la vita.