Il mondo è devastato dalle guerre combattute dagli extended, soldati il cui corpo è stato ibridato con armi biomeccaniche. Juzo Inui è un reduce tornato alla vita civile. Incapace di ricordare il proprio passato prima dell'operazione che lo ha reso un extended, vive ai margini della società occupandosi di crimini in cui sono coinvolti i suoi simili. Juzo e Mary si sono introdotti nel Magazzino delle Armi, la prigione riservata agli extended. Nelle sue profondità si nascondono Twelve, un G.S.U. che tempo prima Juzo aveva eliminato, e Victor, il fratello di Mary, entrambi tenuti sotto sedazione. In quel buio stagnante, ciascuno sarà costretto ad affrontare i fantasmi del proprio passato...