Venuti a conoscenza del passato della scuola, Mikan e i suoi amici tornano nel presente; decisa a fuggire dalla scuola insieme a sua madre, Mikan riceve una pietra alice da Yuka! Quali nuovi poteri potrà offrire ai suoi amici, con questa pietra dentro di sé? Nel frattempo, Tonouchi viene a sapere che tra i suoi compagni c'è un traditore... Come se non bastasse, le grinfie di Persona, a capo del gruppo degli alice di tipo pericoloso, stanno per serrarsi su Mikan e gli altri...