Heidi, lo scienziato ragazzo prodigio, soffre di amnesia. Insieme alla sua assistente, Chitose Toriohji, è in cerca di due oggetti misteriosi, la "mela nera" e il "cadavere rinvenuto", che dovrebbero contenere indizi sul suo passato! Un giorno, il "cadavere luminoso" viene rinvenuto in una città, e due ricercatori che lo stavano studiando... Una saga mistery e scientifica sta per avere inizio!